Gastroenterologistas são os médicos que realizam colonoscopia. Eles completam treinamento de fellowship de 3 anos após residência em clínica médica, dominando diagnóstico e terapia endoscópica do trato GI.
Em alguns ambientes, cirurgiões colorretais ou clínicos/internistas de família especialmente treinados também podem realizar colonoscopias de rastreamento, mas gastroenterologistas são os especialistas primários.