Amostras de biópsia de tumor podem ser congeladas ou incluídas em parafina, fatiadas em secções finas e colocadas em lâminas. Células sanguíneas ou linhagens celulares cultivadas em laboratório também podem ser colocadas em lâminas para exame. As amostras são fixadas nas lâminas com metanol ou formaldeído.
Anticorpos fazem parte da defesa do organismo contra proteínas estranhas presentes em bactérias ou vírus, por exemplo. Um anticorpo é específico para uma única proteína; essa proteína-alvo é conhecida como antígeno. Para imuno-histoquímica (IHQ) de câncer de mama, anticorpos foram desenvolvidos comercialmente e são específicos para a proteína do receptor de estrogênio. Secções de biópsia de mama fixadas são incubadas em solução contendo o anticorpo do receptor de estrogênio; se o receptor estiver presente, o anticorpo se ligará a ele.
Para visualizar os anticorpos, eles são ligados a marcadores que podem corar o tecido, como peroxidase de raiz-forte (HRP), ou a marcadores fluorescentes, como proteína fluorescente verde. As lâminas podem ser visualizadas no microscópio apropriado, e os receptores de estrogênio serão marcados no tecido se estiverem presentes.