Raios ultravioletas (UV) são a principal radiação eletromagnética que induz fluorescência em muitas substâncias. Entender esse mecanismo desbloqueia aplicações que vão da segurança ao diagnóstico médico.
Fótons UV (comprimentos de onda 100–400 nm) excitam elétrons em fluoróforos para estados de energia mais elevados. À medida que esses elétrons retornam ao estado fundamental, emitem fótons de menor energia (comprimento de onda mais longo) no espectro visível — essa emissão é fluorescência. O desvio de Stokes (a diferença entre os picos de absorção e emissão) é uma impressão digital única para cada fluoróforo.
Embora raios X e raios gama possam causar cintilação (em cristais inorgânicos) ou radioluminescência, o UV continua sendo a fonte prática e acessível para a maioria das aplicações de fluorescência. A luz visível também pode excitar fluorescência (ex.: excitação por luz azul de GFP), mas o UV é o gatilho clássico de "luz negra".