Microrganismos (germes) são diversos—bactérias, fungos, vírus, protozoários—e não têm uma única cor. Em culturas de laboratório, algumas bactérias produzem pigmentos que rendem cores de colônia (branco, amarelo, laranja, rosa, preto) dependendo da espécie. Sob um microscópio, colorações como a coloração de Gram diferenciam bactérias Gram-positivas (roxo) de Gram-negativas (vermelho). Atribuir uma cor a todos os germes é cientificamente impreciso; a aparência varia amplamente por espécie e condições.